Уставом АО «ЧЭР» определены следующие органы корпоративного управления и контроля:

• Высшим органом управления АО «ЧЭР» является Общее собрание акционеров.
• Совет директоров АО «ЧЭР» осуществляет общее руководство деятельностью Общества и избирается в количестве не менее 5 человек.
• Руководство текущей деятельностью АО «ЧЭР» осуществляет Генеральный директор, избрание которого отнесено к компетенции Совета директоров АО «ЧЭР».